Die Arbeitsgruppen des Forschungslabors beschäftigen sich schwerpunktmäßig mit:
• Entzündung und Pankreaskarzinogenese (in vitro; in vivo transgene Mausmodelle)
• Pankreasregeneration und epitheliale Entdifferenzierung
• Molekulare Subtypisierung des Pankreaskarzinoms
• Organoidmodelle des Pankreas- und des kolorektalen Karzinoms, in Kooperation mit der Sektion für Interdisziplinäre Pankreatologie der Klinik Innere Medizin 1 und dem Institut für Pathologie
Besondere Schwerpunkte der Arbeitsgruppen im Forschungslabor sind die Analyse der frühen Entdifferenzierung von Pankreasepithelzellen hin zu Vorläuferläsionen des Pankreaskarzinoms. Hierzu werden vor allem transgene Mausmodelle verwendet, in denen Onkogene spezifisch und zu bestimmten Zeitpunkten im Pankreas exprimiert werden. Zur Karzinogeneseinduktion nutzen wir zusätzlich Modelle der Pankreatitisinduktion. Als Analysemethoden kommen neben der klassischen Molekularbiologie und Immunohistologie auch RNA-Sequenzierung, lineage tracing (mit entsprechenden in vivo Markern), epigenetische Analysen, Transkriptomanalysen, sowie als wichtiges Bindeglied bioinformatische Analysen und mathematische Modellierung zum Einsatz. Wir haben zudem verschiedene in vitro Primärzellkulturmethoden entwickelt, um insbesondere die Transdifferenzierung vom azinären zu einem eher duktalen Phänotyp als einem der ersten Schritte in der Pankreaskarzinogenese besser analysieren zu können und auch ausserhalb der komplexen und langwierigen Mausmodelle abzubilden